📌 引用声明(Citation)
本文部分数据整理、研究背景与研究方向参考自微信公众号文章:
《焦虑/抑郁相关多组学研究资源梳理》
原文链接:
https://mp.weixin.qq.com/s/rqbTRxpaY0EGk3uf1R5XJA
本文在此基础上进行了补充,仅用于科研学习与资源汇总,不构成任何商业用途。
一、方法学与工具
| 类型 |
名称 |
说明 |
| 方法 |
gsMAP |
基于 GWAS + 单细胞的疾病风险映射(Nature 2025) |
| 工具 |
scDRS |
单细胞疾病风险评分 |
| 工具 |
scPagwas |
单细胞层面多基因风险富集分析 |
二、GWAS 资源
| 类型 |
资源 |
说明 |
| 焦虑 GWAS |
Anxiety disorders meta-analysis |
鉴定焦虑障碍新风险基因 |
| 数据库 |
IEU Open GWAS |
大规模 GWAS 汇总下载 |
三、转录组 / 单细胞 / 空间组学数据(GEO)
3.1 表达谱 / RNA-seq(人类 & 动物)
| GSE编号 |
物种 |
组学类型 |
样本量 |
疾病/模型 |
组织 / 系统 |
简述 |
| GSE151807 |
小鼠 |
表达谱 |
24 |
CMS 抑郁模型 |
杏仁核/海马/PFC |
慢性应激诱导抑郁 |
| GSE98793 |
人 |
表达谱 |
192 |
MDD |
外周血 |
抑郁症转录特征 |
| GSE87082 |
大鼠 |
表达谱 |
60 |
高/低焦虑行为 |
PFC/杏仁核 |
情绪行为差异 |
| GSE61672 |
人 |
表达谱 |
546 |
焦虑症 |
外周血 |
焦虑相关分子通路 |
| GSE54572 |
人 |
表达谱 |
24 |
MDD |
前扣带回 |
脑组织多组学 |
| GSE54568 |
人 |
表达谱 |
30 |
MDD |
DLPFC |
共表达模块 |
| GSE54566 |
人 |
表达谱 |
28 |
MDD |
杏仁核 |
情绪相关脑区 |
| GSE306819 |
人 |
snRNA-seq |
82 |
双相障碍 |
丘脑/PFC |
细胞类型差异 |
3.2 单细胞 / 空间转录组图谱
| 资源 |
物种 |
类型 |
说明 |
| MCA |
小鼠 |
单细胞 |
小鼠细胞图谱 |
| Mouse Brain Atlas |
小鼠 |
空间转录组 |
全脑空间图谱 |
| Anxiety mouse atlas |
小鼠 |
单细胞整合 |
区域/性别特异网络 |
四、DNA 甲基化 / 表观组
| GSE编号 |
物种 |
技术 |
样本量 |
疾病/模型 |
样本 |
| GSE198904 |
人 |
EPIC array |
655 |
MDD |
血液 |
| GSE178128 |
人 |
WGBS |
66 |
PTSD / MDD |
血液 |
| GSE164056 |
人 |
甲基化芯片 |
143 |
社交焦虑 |
血液 |
| GSE126955 |
小鼠 |
WGBS |
9 |
应激易感 |
伏隔核 |
| GSE54370 |
人 |
MeDIP-seq |
46 |
MDD |
双胞胎 |
五、非编码 RNA(miRNA / small RNA)
| GSE编号 |
物种 |
技术 |
样本量 |
疾病/模型 |
样本类型 |
| GSE148576 |
人 |
small RNA-seq |
122 |
MDD |
血浆外泌体 |
| GSE97154 |
人 |
small RNA-seq |
516 |
MDD |
外周血 |
| GSE152267 |
人 |
miRNA芯片 |
20 |
单相/双相抑郁 |
血浆 |
| GSE131289 |
大鼠 |
small RNA-seq |
20 |
社会隔离应激 |
BNST |
| GSE58105 |
人 |
miRNA芯片 |
25 |
MDD |
前额叶皮层 |
六、RNA 修饰 / 翻译组 / 蛋白互作
| GSE编号 |
技术 |
靶点 |
物种 |
关联 |
| GSE306790 |
RIP-seq |
YTHDF1 |
小鼠 |
焦虑/抑郁 |
| GSE275676 |
m6A-seq |
m6A |
人 |
性别差异 |
| GSE287356 |
MeRIP-seq |
lncRNA m6A |
小鼠 |
脑损伤/情绪 |
| GSE239412 |
Polysome |
翻译效率 |
人 |
情绪障碍 |
| GSE219136 |
CRISPR |
全基因组 |
人 |
功能筛选 |
七、说明
- 本资源适用于:
- 多组学整合分析
- GWAS → 单细胞 → 表观组映射
- 焦虑 / 抑郁 / PTSD / 自杀相关研究
- 所有数据均来自 GEO / 公开数据库 / 已发表研究