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焦虑 / 抑郁相关多组学研究资源

📌 引用声明(Citation)

本文部分数据整理、研究背景与研究方向参考自微信公众号文章:
《焦虑/抑郁相关多组学研究资源梳理》
原文链接:
https://mp.weixin.qq.com/s/rqbTRxpaY0EGk3uf1R5XJA

本文在此基础上进行了补充,仅用于科研学习与资源汇总,不构成任何商业用途。


一、方法学与工具

类型 名称 说明
方法 gsMAP 基于 GWAS + 单细胞的疾病风险映射(Nature 2025)
工具 scDRS 单细胞疾病风险评分
工具 scPagwas 单细胞层面多基因风险富集分析

二、GWAS 资源

类型 资源 说明
焦虑 GWAS Anxiety disorders meta-analysis 鉴定焦虑障碍新风险基因
数据库 IEU Open GWAS 大规模 GWAS 汇总下载

三、转录组 / 单细胞 / 空间组学数据(GEO)

3.1 表达谱 / RNA-seq(人类 & 动物)

GSE编号 物种 组学类型 样本量 疾病/模型 组织 / 系统 简述
GSE151807 小鼠 表达谱 24 CMS 抑郁模型 杏仁核/海马/PFC 慢性应激诱导抑郁
GSE98793 表达谱 192 MDD 外周血 抑郁症转录特征
GSE87082 大鼠 表达谱 60 高/低焦虑行为 PFC/杏仁核 情绪行为差异
GSE61672 表达谱 546 焦虑症 外周血 焦虑相关分子通路
GSE54572 表达谱 24 MDD 前扣带回 脑组织多组学
GSE54568 表达谱 30 MDD DLPFC 共表达模块
GSE54566 表达谱 28 MDD 杏仁核 情绪相关脑区
GSE306819 snRNA-seq 82 双相障碍 丘脑/PFC 细胞类型差异

3.2 单细胞 / 空间转录组图谱

资源 物种 类型 说明
MCA 小鼠 单细胞 小鼠细胞图谱
Mouse Brain Atlas 小鼠 空间转录组 全脑空间图谱
Anxiety mouse atlas 小鼠 单细胞整合 区域/性别特异网络

四、DNA 甲基化 / 表观组

GSE编号 物种 技术 样本量 疾病/模型 样本
GSE198904 EPIC array 655 MDD 血液
GSE178128 WGBS 66 PTSD / MDD 血液
GSE164056 甲基化芯片 143 社交焦虑 血液
GSE126955 小鼠 WGBS 9 应激易感 伏隔核
GSE54370 MeDIP-seq 46 MDD 双胞胎

五、非编码 RNA(miRNA / small RNA)

GSE编号 物种 技术 样本量 疾病/模型 样本类型
GSE148576 small RNA-seq 122 MDD 血浆外泌体
GSE97154 small RNA-seq 516 MDD 外周血
GSE152267 miRNA芯片 20 单相/双相抑郁 血浆
GSE131289 大鼠 small RNA-seq 20 社会隔离应激 BNST
GSE58105 miRNA芯片 25 MDD 前额叶皮层

六、RNA 修饰 / 翻译组 / 蛋白互作

GSE编号 技术 靶点 物种 关联
GSE306790 RIP-seq YTHDF1 小鼠 焦虑/抑郁
GSE275676 m6A-seq m6A 性别差异
GSE287356 MeRIP-seq lncRNA m6A 小鼠 脑损伤/情绪
GSE239412 Polysome 翻译效率 情绪障碍
GSE219136 CRISPR 全基因组 功能筛选

七、说明

  • 本资源适用于:
    • 多组学整合分析
    • GWAS → 单细胞 → 表观组映射
    • 焦虑 / 抑郁 / PTSD / 自杀相关研究
  • 所有数据均来自 GEO / 公开数据库 / 已发表研究

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